蜂王漿的採收過程中，可能會有切除王台口封口蠟的碎片及蜂王幼蟲等物質混入王漿中，影響蜂王漿的品質。

因此新鮮採收的蜂王漿最好立即以60～100目的過濾網進行過濾。若是先冷凍儲存再解凍過濾，要留意蜂王漿中的有效成分10-DHA會因冷凍過程使其產生結晶，解凍後之蜂王漿進行過濾會把10-DHA晶體濾掉，因此過濾解凍後的蜂王漿必須將濾渣用無菌水漂洗回收10-DHA後再混入濾過的王漿中，以維持蜂王漿的品質。