文心蘭容易在悶熱、溼度高、通風不良的環境下，造成疫病、軟腐病、炭疽病、灰黴病…等產生。
在病害的防治上，首重田間衛生管理，及防止蘭園之周邊雜草叢生，發現病株須立即清除或燒毀；以藥劑防治上，以普拔克1000倍、快得寧1500倍或依得利1500倍防治疫病，大生粉、鏈黴素1000倍、氫氧化銅500倍等藥劑去防治軟腐病，好速殺5000倍、普克拉猛3000倍去防治炭疽病，依普同1500倍、貝分替1500倍去防治灰黴病，藥劑要輪流使用以免產生抗藥性。