番荔枝開花後之雄蕊花藥散放時間，大約自凌晨2：00至早上8：00間，品種（系）不同，散放時間亦有差異；‘軟枝品系’、‘粗鱗品系’、‘紫色品系’、‘台東一號’與‘大目種’等不同品種（系）之大部分花朵達授粉期之花藥散放時間，可依序為‘軟枝品系’最早於凌晨2：30~4：30間，其次為‘粗鱗品系’與‘紫色品系’於清晨4：30~6：30間，而‘台東一號’與‘台東二號’於早上6：30~8：30間。

雖然受氣候因素影響，花藥散落時間會稍有提前或延後，如逢多雲天，少日照，氣溫低，則授粉期之花藥散放時間會稍有提前（早）；而遇天氣晴朗，艷陽高照，晴空萬里，氣溫高，則會有延遲雄蕊花藥之散放，授粉期之發育則會稍有延後。

於凌晨至清晨間，當花朵上之三個肉質花瓣同時各自向外側反舉，開裂至90~180°最大角度時，隱藏於花瓣基部，花托下方之雌雄蕊已曝露可見，接著團聚叢生於花托上之花藥開始向外突起，且各自散開，約於五分鐘內199只/朵花藥開裂而花粉開始紛紛散落，而柱頭上溢有黏液之分泌物，適時可提供協助授粉，促使花粉發芽，約二個小時後，向外側反舉之三個花瓣，開始軟化漸次下垂，花瓣褪色、老化，約二天後乾枯呈褐色，有的掉落，有些乃掛留果梗上。

而番荔枝之冬季修剪與夏季修剪後開花之花藥開裂授粉行為與時間均相當一致，並無區別。