越冬溝的設置，是淺坪是養殖的一大特色。在淺坪式養殖，水池的水深較淺，在冬天，很容易因為寒流使魚塭溫度劇降，造成寒害(虱目魚大量死亡)，故一般會設置越冬溝讓魚避過寒冬。

        越冬溝的結構可分為深溝與淺坪兩部分，深溝是主要避寒處，淺坪是虱目魚攝食的地方。深溝可以避寒害的主要原理在於，水的密度在4℃時最大，也就是4℃的水會沉在底部。所以如果水體的深度夠深，在底部最低溫都會維持在4℃，虱目魚在此活動，較不會受到寒流水溫劇烈改變而影響。深溝是東西向與北略偏東成直角關係，水深約1.5~2.0公尺，上寬5~8公尺，底窄約1.2~1.5公尺，並在北邊做防風棚，其斜度與水平成30~60度，由於下霜的機會減少，也慢慢的使用垂直式防風棚，防風棚早期使用茅草、稻草，近來則改用帆布或不織布。淺坪與深溝同長，其寬度早期在25公尺，近來較狹小約為10公尺，淺坪與深溝間設有水門，使魚可自由出入，遇寒流來臨，魚進入深溝後可關起來，減少因水對流而使水溫下降，一般如此操作可增加水溫3~5℃。只是越冬溝的防寒還是有限,遇到較強的寒流,虱目魚依然經常凍死。而且越冬溝中的魚苗密度很高,水質變化大,魚體受傷寄生蟲感染或病毒感染也都會導致虱目魚的大量死亡。