荔枝是常綠喬木，樹型高大，樹齡可達上百年甚至千年。荔枝根系龐大，由主根、側根、密集的細根和大量菌根所組成，且會因苗木繁殖方法不同而異。實生繁殖者或實生砧木嫁接繁殖的樹，具有發達的主根，一般無性繁殖之植株，包括扦插及高壓繁殖之苗木，沒有主根，只有發達的側根，多由很多粗狀發達的側根和纖細茂密的細根所組成，荔枝的側根為灰褐色，其上密生細根，初生的幼根白色、海綿層厚、稍有彈性、質脆易斷、不具根毛。荔枝幼根常與真菌共生，形成內生菌根，為總狀分枝式。