本試驗旨在探討雞糞墊料經舍內長條(windrow)堆置處理後對病原菌數量之影響。雞糞墊料來源為剛出清雞隻之商業白肉雞場，處理組採2 × 2複因子設計，分別為2種堆置高度(40 cm、55 cm) × 2種含水率(30 ± 2%、37 ± 2%)，各處理組均以長條靜態型式堆置處理12天，並於堆置後第5及第9天進行翻堆，每日記錄墊料堆中心與表層溫度，並於d1、d5、d9及d12採樣分析雞糞墊料中病原菌數量。結果顯示，墊料堆中心及表層溫度皆能達到55℃以上，並可持續維持超過3天，且顯著降低內含之總生菌數、厭氣菌數、大腸桿菌群、金黃色葡萄球菌、沙門氏菌、空腸彎曲桿菌與梭菌之數量。綜上所述，雞糞墊料進行舍內堆置處理期間，高溫發酵階段溫度可達到殺菌之基本要件(55℃以上連續3天)，且顯著降低內含之病原微生物數量。