種子的保存第一部先篩選種子，應為無雜質，無其他病蟲害，成熟具有活力者。種子表面水分過多者應去除，以免種子因水分影響發芽。

耐貯型種子:

耐貯型種子為一般穀類、蔬菜等小粒種子，可在低溫、低濕的環境。長期貯藏，依保存目的不同，分別貯藏於長期庫(種子貯藏壽命可達30至50年)、中期庫及短期庫。

不耐貯型種子:

不耐貯型種子，如可可、龍眼、荔枝等多數熱帶果樹、及大粒種子於0℃下貯藏常造成傷害，僅能視其特性進行冷藏保存於0℃～15℃，其貯藏期間較短。種子壽命也依作物種類而異，約僅有1至5年。