(一)擴大有機生產，促進農業永續發展
現行作物有機栽培模式除水稻以產銷班經營方式外，其餘蔬菜及果樹等作物仍以零星栽培為主。未來將輔導農友配合「小地主大佃農」機制，並利用台糖土地、輔導會農場建立有機農業專區，輔導有機農友大面積租用農地，擴大經營規模。另鼓勵以有機農業結合觀光休閒產業經營，協助吉園圃產銷班轉型為有機栽培等，朝多元化經營，進而提升農友收益。
(二)提升栽培技術，提升經營收益
建立整體性之作物有機栽培技術後，推廣農友採行，逐步改善作物有機生產技術，增進農友投入有機農業經營意願，提升經營收益。
(三)落實有機農產品認驗證制度，建立消費者信心。
依據「有機農產品生產及驗證管理法」規定，辦理有機驗證機構查核及產品抽驗，確保有機農產品驗證公信力，建立消費者信心。
(四)推廣OTAP有機農產品標章，辨識更為容易，保障消費者權益。
有機農產品之生產過程有別於一般農產品，但無法由外觀或分析其化學成分加以區別，因此，先進國家均建立完善之認驗證制度，並訂定有機農產品標章與標示，期有效管理有機農產品之生產與加工處理。配合「農產品生產及驗證管理法」之實施，農委會已宣示自2009年起有機農產品全面轉換為OTAP標章，以方便消費者在選購時辨識。
(五)通路趨向多元化，擴大消費層面
輔導經有機驗證的專業分裝或流通中心，以快速、安全的作業系統，取代一般傳統包裝場或集貨場。另電子商務提供消費者選購有機農產品的便利性；生產者長期與消費者建立良好的互動關係，成為定期高忠誠度的宅配客戶；有機農夫市集提供在地的有機農產品，成為消費者搶鮮的新選擇，為有機農產品通路發展目標。