玉米莖腐病在持續高溫（27~30℃）及多濕（85%以上）之情況，對玉米易造成摧毀性之危害。玉米開花前均可被感染，感染部位以靠地面第二節之莖部居多。被感染部位常呈棕褐色，發惡臭，腐爛，致植株倒伏。防治法為栽培抗病品種如台南11號及台南16號。發病時不可培土及灌水，俟氣溫降至19℃以下時再進行作業。因高溫下培土及灌水會促進病原菌之入侵與蔓延。發病時可施用鋅錳—滅達樂（Ridomil-MIZ）400倍加展著劑CS7（Triton）2,000倍，噴灑在玉米基部以防病情擴大。