一、病徵與發生型態:
本病發生於雌雄穗、莖、葉、根等部位，但普通以側芽、花穗及葉部最多。患部形成異常肥大之瘤，幼苗時期感染於葉片莖上可見小瘤，而幼苗則停止生長，造成植株矮化，甚至褐變枯死。被病原菌感染之寄主，受刺激使寄主細胞分裂，組織膨大，形成瘤。瘤初期由綠白色薄膜覆蓋，後期成熟時大小可達十公分以上，其內部變暗，膜變為灰白色，最後膜破裂，散出棕色至黑色的粉狀冬孢子。莖部除非受到機械損傷否則少見腫大。

二、傳播途徑:
冬孢子能在土壤中休眠及植物殘體內存活，當環境適宜時，冬孢子發芽產生擔孢子，藉由空氣與水飛濺傳播，成為初感染源。冬孢子若是在生長季節中，落到幼嫩組織則可重複感染植株。

三、防治方法:
1. 栽種抗病品種：目前硬質玉米抗感性差異不大，但進口甜玉米之感病性則不一致，可選擇較抗病之品種。
2. 田間衛生：發現黑穗病之病株時，應在腫瘤破裂冬孢子散出前將其清除，以免成為二次感染或下期作之感染來源。
3. 藥劑防治：種植前依照植物保護手冊推薦藥劑進行種子拌藥處理。
(1) 40%滅普寧水懸劑 (Mepronil):
a. 施藥量為 1毫升/每公斤種子
b. 先用10毫升蒸餾水與1毫升藥劑充分混合，再拌入種子內。

(2) 75%滅普寧可濕性粉劑 (Mepronil)
a. 0.5公克/每公斤種子
b. 播種前拌種施藥，藥先溶於10毫升蒸餾水中再和1公斤種子充分混合。