小米為耐旱作物，水份利用效率高於玉米、小麥及高粱，小米之耐旱能力和其密集的根系、厚細胞壁、葉面積小及表皮細胞排列的方式有關。Zhang等人(2007)表示在乾旱逆境下，於小米莖部及根部有表現之基因，分別有75%及60%尚未在其他物種中發現，顯現小米對乾旱逆境具備之特有反應。小米發芽時對水分要求不多，土壤含水量達9~15%就能發芽，土壤含水量達50%時幼苗出土較快，過於潮濕會造成發芽不良。小米的臨界需水期有二，一為拔節~開花期間，此時期遇乾旱會影響枝梗及小穗分化，導致穗粒數減少，或造成抽穗困難及花粉發育不良，而產生大量秕粒。籽實形成期為小米的第二個臨界需水期，為決定穗重及粒重的關鍵時期，若遇乾旱會阻礙籽粒充實，致秕粒率增加而減產。