最早發現者：Moore et al.（1922）， 六鞭毛蟲具四對鞭毛，其中前鞭毛3對，後鞭毛1對，並形成軸桿。胞核1對，在蟲體前端呈八字排列，蟲體一般呈棃形、後端尖銳，無切口及胞口，軸桿的結構較複雜，由1對副原纖維的空管，其中包裹著後鞭毛，通過蟲體向後延伸，毛基體在胞核之前。後鞭毛沿著蟲體部份與胞質相連，成為軸桿。蟲體之滋養型態一般呈卵圓形，兩側對稱，背腹扁平。滋養體在宿主腸管內繁殖分裂，最後形成卵圓形包囊，包囊可在水中生活數天，最多7天(行政院農委會家畜試驗所)。