小型豬飼育設施位於山坡地區，為防範氣候異常可能造成的災害，確保國家種原與人員安全，每年定期舉行災害應變演練，使人員提高警覺，熟練應變程序，並規劃緊急撤離路線與避難場所。
演練項目包含：
(1) 預防人員傷亡之措施。
(2) 預防種豬傷亡絕種之措施。
(3) 預防豬場硬體設備損毀措施。
(4) 預防種豬軟體資料損毀措施。

每逢颱風、豪雨警戒期間，工作同仁隨時掌握颱風、豪雨之動向，並依據地方指揮中心指示，發佈黃色警戒時，完成撤離之準備，發佈紅色警戒時，工作人員立即可將關鍵性動物個體與重要文件資料撤離至指定之避難場所。