SOP（即標準作業程序書）是管理者與現場專家多年實際工作的智慧及經驗集結成的工作指導文件，主要功能是讓組織內各項工作之運行均有文件資料遵行。藉著說、寫、作標準一致的動作，可減少工作發生偏差異常的機會，一旦出現偏差異常，核對該項工作的SOP，也可於最短時間內檢視出問題，加以矯正。SOP的另一項功能是藉PDCA循環（即P：政策或工作，D實行，C檢討，A改善）運作讓組織的政策及工作品質不斷精進，永不會落伍。

工作團隊於民國97年執行「最少病原小型豬之生產與供應」計畫，目的是提升生醫用小型豬之人道管理以及健康品質，而計畫的首要工作就是建立SOP制度，以「實驗動物飼養管理和使用指南」及各項相關法規為規範，集合所有管理及現場工作人員，逐項撰寫，經一年多的努力共計完成35項SOP，表單96張，舉辦文件發表會，經全場人員充分討論，修正審查後為正式發行之版本。