苦瓜栽培期間常會遇到蚜蟲、瓜螟及瓜實蠅等害蟲為害，一般都會施用殺蟲劑以防止害蟲，取用這些材料生產保健食品，安全堪慮；因此利用有機栽培量產模式生產保健用苦瓜，將會是生產與消費雙贏的作法。

苦瓜育苗期間於初生本葉時可能遇到斜紋夜盜蟲幼蟲咬食葉片為害；生育初期會遭遇蚜蟲於葉背為害。莖葉抽長後於新生出之葉片會有瓜螟幼蟲開始為害(附圖)。

 

利用不同顏色粘紙誘引並黏著防治各種小型昆蟲，如黃色粘紙可誘殺粉蝨、蚜蟲、斑潛蠅及瓜實蠅等，藍色粘紙可誘殺薊馬，可減少害蟲之族群密度。蚜蟲及葉蟎可噴施窄域油500倍防治。田間釋放捕食性天敵如小黑花椿象主要捕食蝶、蛾類幼蟲、草蛉可捕食葉蟎、蚜蟲類、粉蝨類。斜紋夜盜蟲可應用性費洛蒙緩釋劑懸掛誘蟲盒誘殺，每公頃設置5~10個或利用蘇力菌在清晨或傍晚時進行防治。結果期則需防止瓜實蠅的為害，被害率隨瓜實蠅之族群密度增高而加大，以謝花至瓜長2~3公分之被害率最低，苦瓜授粉後2-3天開始易被瓜實蠅產卵，噴施蛋白質水解物可誘殺雌蟲及雄蠅；克蠅香誘殺器懸掛於瓜田四週欉林或樹木間蔭涼處，避免陽光直射，瓜園每公頃設置10~20個；利用農藥空瓶或塑膠瓶噴上黏膠，亦可誘引瓜實蠅。

 

苦瓜生育期間如果受到瓜螟危害而沒有加以防制，數量將快速增加，結果期間之果實及老葉也受到為害(附圖)。

 

苦瓜栽培期間常會遇到蚜蟲為害，一般於定植後1-2週即可於本葉之葉背看到蚜蟲由數隻而變群落，如果沒有加以防除，將快速增加進而為害新芽(附圖)，使得枝條無法正常生長，嚴重時將使株株枯死。

 

苦瓜生育期間遇到斜紋夜盜蟲幼蟲咬食葉片，由點狀為害，隨著蟲體長大進而為害大片葉面，等果實長出後，將危害果面及果肉(附圖)。

 

苦瓜栽培期間遇到蚜蟲為害葉片是從定植之後就可能遇到，常從葉背開始為害，迅速繁殖，再為害新芽，嚴重時將使的植株無法正常生長。