目前的國產薏仁產地，多集中在臺中市大雅區、彰化縣二林鎮、嘉義縣朴子市、東石鄉及南投縣草屯鎮等地。其栽培品種多為臺中區農業改良場自日本引進選育的薏苡品種，包括臺中1、2及3號。這些薏苡品種的籽實脫殼後，其籽粒長寬均較進口薏仁小，進口薏仁籽粒長度多在7公釐以上，寬度在5-6公釐間，而國產薏仁籽粒長5-6公釐，寬度在5公釐左右，此為國產薏仁及進口薏仁外觀上的明顯差異。國產薏仁及進口薏仁在籽粒重量上也明顯不同，國產薏仁千粒重80克左右，進口精白薏仁千粒重約在140-150克間。另目前臺灣推廣薏苡品種屬糯性品種，食用上口感較Q彈。且國產薏仁以脫殼後保留外層紅色麩皮的糙薏仁型式加工販售，又稱紅薏仁，營養價值高。
　　由於薏仁脂質含量較一般穀類高，不易保存，如保存不當，可能產生黃麴毒素污染，選擇臺灣本土生產薏仁，更新鮮健康。此外，坊間常見所謂洋薏仁、珍珠薏仁或小薏仁，其實是大麥仁(Barley)，消費者在選購時可詳細參閱產品包裝後方說明。