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宜蘭及花蓮為台灣重要的原住民地區，具備天然環境以及保留豐富完整的部落文化與原住民特色作物資源，然而部落普遍面臨青年人力外移、耕作人口老化、傳統特色文化作物流失等問題，導致部落特色農產業逐漸凋零。行政院農業委員會花蓮區農業改良場為協助恢復原鄉特色作物的復耕以及原鄉部落農產業的轉型與發展，以部落特有原民農業文化為出發點，結合花蓮農改場的核心價值─有機樂活、健康安全及原民產業為目標，將花蓮及宜蘭原鄉農業輔導列為首要任務推動，積極輔導宜花地區原住民部落農產業發展。
花蓮農改場於103年推動原住民農產業輔導及科技研發專案，擬定原鄉部落輔導流程，第一步先是設置部落聯繫窗口，盤點部落農產業的概況以及面臨的困難與缺口後，依照各部落之產業狀況，召集不同領域研究人員籌組輔導團隊以提供客製化諮詢及服務。另外，針對部落對農業專業訓練課程的需求，創設部落行動教室，現地進行客製化輔導與講習，使交通較不便利的原鄉部落同樣享有即時高品質的輔導資源。而鑑於原住民農村開發休閒產業之需求，花蓮農改場也積極辦理部落農遊輔導工作，進行創意部落旅遊規劃與設計，以及旅遊行程行銷課程輔導，透過陪伴輔導師制度，定期與部落成員共同凝聚創意，規劃特色農業旅遊套裝行程，以期發展具個別部落特色的部落休閒產業。
為提供原鄉特色農業更完善的輔導與服務，花蓮農改場更於104年8月特別成立原住民農業研究室，投入專門研究人力，針對原鄉特色作物進行種原蒐集及保存、價值潛力評估與開發、栽培技術的改進、有機栽培友善環境技術的研發以及品種的改良等工作，期望透過生產、栽培等基礎研究從而穩定部落一級產業的發展，以提升部落特色農產業的競爭力，未來也將持續進行後續的採後處理及加工技術的建立，期望建立原鄉部落特色作物生產、加工、包裝行銷乃至觀光休閒的六級化產業的發展。目前花蓮農改場蒐集及保存的原住民特色作物地方種種原已超過五十種且皆以種子為主，其來源大部分皆來自花蓮地區的原住民部落，大部分的種子在低溫及低濕的貯藏條件下，其保存的年限越長，故由原鄉部落所蒐集的地方種種原，主要以低溫貯藏保存。除此之外，也設置田間的植株活體種原保存圃，以供種原的保存與每隔一段時間進行低溫種子庫的種子更新。另外，花蓮農改場也輔導協助原住民農友設置原民植物種原保種圃，以蒐集及保存與部落文化相關之種原。
除了客製化的栽培技術與產銷組織經營管理輔導外，花蓮農改場亦投入大量資源盤點及歸納原鄉農產業發展的前瞻性方向。首先為了廣納國內外專家學者的建議及相關經驗的分享與交流，於105年舉辦「原鄉特色作物與傳統文化產業創新發展國際研討會」， 針對政府輔導與推動原鄉農產業的建立、原鄉特色作物科技研發與產業加值，以及原鄉特色農業在地知識之創新發展等角度，激盪出未來原鄉農產業的推動及多元化發展的更多可能。此外，花蓮農改場亦委託台灣農業科技資源運籌管理學會，協助盤點國內外原住民潛力發展的作物品項、價值研究、市場成功因素及推廣策略等，並作出詳盡的分析與產業推動建議，有助於增進推動原住民農業輔導及科技研發的知識與創意。
宜花地區的原鄉部落具有豐富的人文及自然資源，花蓮農改場配合各部落不同資源特色及農產業輔導需求，協助發展部落特色農產業，並以部落特色作物轉作有機生產為方向，積極輔導原住民農友復耕並轉型有機栽培，並在有機基礎上發展維護部落自然環境與生態的農法，近年來更結合與自然和諧共生的「里山倡議」理念，保留部落傳統尊重土地與環境的精神與文化核心，進一步推展農產業的轉型加值。花蓮農改場在部落深耕多年的努力之下，轄內部落的農業發展已逐漸形成亮點，以一級、二級至三級全方位面向，輔導建立六級化農產業經營模式，以解決原住民在生產、加工、銷售與品牌的缺口，期望有助於吸引年輕族人從事在地農業生產，提供就業機會來活絡部落農產業發展。