採後處理是為了維持或提升園產品採收後至消費者購買、食用時的品質。藉著預冷、催熟、低溫及包裝等方法來延長貯藏壽命。百香果採收後果實仍會進行呼吸、蒸散作用及其他的生理作用，果實品質也會隨著採收後的時間及環境逐漸下降。而呼吸作用會消耗氧氣，葡萄糖氧化或有機酸產生能量供應其他生理作用的進行，造成果實外觀品質的改變、糖度降低等。百香果屬於更年型果實，在採收後果實後熟過程中會有明顯的更年型果實呼吸率上升，且伴隨乙烯釋放率增加的情形。因此，為降低採收後品質改變的速度，延長販售時間，採收後適當之貯藏溫度是必要的。百香果果實於室溫環境下貯藏壽命約 7-10 天，貯藏期間易發生失水萎縮、黴菌產生及果汁發酵、腐爛的情形，嚴重會影響果實外觀、重量、風味與營養價值。低溫貯藏可降低果實呼吸作用、蒸散作用、乙烯生合成等生理現象，延緩品質損耗與微生物滋生造成果實腐敗。但當百香果貯藏於 6℃以下的溫度則會導致寒害發生，常見的蔬果受到寒害時可能產生一種或多種症狀。如外表有凹陷斑點或斑塊、表皮呈燙傷狀或水浸狀塊點、內部變黑或成暗褐色、後熟異常、組織軟化崩潰、成分變化導致異味、加速腐爛、喪失再生能力等。由於上述一種或多種症狀而縮短貯藏壽命。而百香果寒害症狀為果皮發生軟化及不正常變色情形，隨著紫色種果殼的軟化可能會使花青素滲入果汁之中，反而加速果實品質劣化及改變果汁顏色。百香果採收後最合適的儲存溫度為6.5℃，相對濕度保持在85~90%可保存4-5週而不影響品質。
百香果果實適合的貯藏溫度可能因品種、成熟度及栽培地來源不同而有所差異，但皆推薦低溫貯藏較能延長貯藏壽命與維持鮮食品質。