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龍眼依品種不同，約於春天3-5月開花，花屬於蟲媒花，為良好的採蜜蜜源，在栽培區放養蜜蜂，可幫助授粉，提高結果率。龍眼花序為聚繖圓錐花序，生於枝條頂端，其上由許多聚繖花序單元所構成，花序有許多分枝－主枝(一級結構)；分枝(二級、三級、四級結構…)。
花序上由重複的小單元構成
龍眼花朵具花瓣 5 枚、萼片5裂、雄蕊 8 枚，子房上位、心形、2室，柱頭2裂，佈滿絨毛，主要分為三種花性：雄花、偏雌花及偏雄花。
1. 雄花之子房及柱頭退化，無結果能力。
2. 偏雌花之雄蕊退化，為主要具有結實能力的花器。
3. 偏雄花之子房及柱頭退化程度較低，仍可看見突起構造，無結果能力。
花序構造示意圖
龍眼之花序是否形成，可由側芽位置是否可見分枝結構或苞片原基(bract primordia)來判定。花朵開放時，通常分為三波，且通常第一波為雄花、第二波為偏雌花、第三波為偏雄花。每個聚繖花序單元會由頂端的花芽開始開放，然各花性的數量會因品種而有不同，例如：編號1-2之花芽通常為雄花，編號2-3通常為偏雌花、編號3-4通常為偏雄花。
此外，花性分化可能受環境因子(例如：溫度、水分…)或樹體狀態(例如：栽培管理、植體營養…)影響，有時候第一波花期會跳過雄花，直接開放偏雌花。由龍眼開花習性可知，原則上每一種子為天然雜交所成，因此後代會產生許多變異。
龍眼每穗小花數約數百朵至數千朵，雌花率約10-30%。主要開花期約在3月下旬至4月下旬，花期約持續1個月。南部開花較早，約3月中、下旬，越往北越遲，最慢約在5月初。
龍眼蜜腺位於花芘基部，略鼓凸。各種性型的花都有，而以雌花的蜜腺蜜量最多。泌蜜時喜歡溫度高濕度大環境，蜜量上午較多，下午漸少。天氣晴朗，夜間氣溫20℃以上時，泌蜜量最大。開花適溫在20～27℃之間，低於13℃或高於30℃，開花減少。花期中的雨量，嚴重影響龍眼花泌蜜，雨多不僅蜜量少，而且蜜中水分多品質不佳，同時雨大會沖失花蜜，所以，此時少雨是龍眼蜜豐收的先決條件。
(本段摘自台灣最重要的蜜源植物～～龍眼/陳運造https://www.mdares.gov.tw/ws.php?id=980)
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