第一棟木屋為位於六龜研究中心之扇平工作站之通舖,建於1937年,1996年拆除,拆除共費29工,其中5 工為廢料清理及搬運。木屋以瓜柱承接檁條,屬穿斗式構架。木屋座東南朝西北,呈倒T字型,室內面積約104 m2(平方公尺)。 地基周邊為高45 cm帶通氣窗的混凝土勒腳牆,其上承接紅檜地檻。地板樑在通舖兩側因距外圍較近,故使用高耐腐性的紅檜,通舖中央因強度需求大,亦使用紅檜,均由混凝土地板支柱支撐;其餘使用杉木剝皮原木為地板樑,由直接座落於一塊頁岩上的杉木地板支柱支撐;地板樑上方有長方形刻槽,以承接平行面闊方向之柳杉地板托樑,紅檜地板則釘於地板托樑上。地檻及紅檜地板樑,四面均塗有煤焦油以防腐。
屋身為露柱式構造,柳杉屋柱上承屋頂構架材(簷枋或屋架大樑),下接地檻或紅檜地板樑。兩屋柱間有間柱及橫向灰板條,附以竹條編成之格子網,覆以泥土後,表面再塗以白色石灰,構成內部的編竹灰泥牆;外壁則釘以雨淋板,板上塗刷有柏油。間柱及灰板條並不負承重之責,僅作為編竹灰泥牆之骨幹。屋頂構架最下為簷枋,其上搭以屋架大樑,再以瓜柱直接承接檁條,檁條上釘以椽條,椽條上釘以橫向柳杉望板,再覆以油毛氈及鐵皮浪板。 以外觀而言,木屋整體結構完好無損,但有下列損毀:浴室外牆之窗檻因濕度太高,有腐朽發生;靠浴室的地檻,雖然使用耐腐力強之紅檜,也有類似情形,此處地檻上之兩根柳杉屋柱下端,有嚴重腐朽。木屋背山,左側有作辦公室用之二層建物為屏障,故被覆之雨淋板均完整;右側山牆則直接受到日曬雨淋,而有風化現象,雨淋板之春材部份陷入材面0.4 至0.7 cm,據文獻指出每10年春材平均風化0.1 cm;位於右側山牆與正面所成屋角之雨淋板發生腐朽,導致所被覆之角柱腐朽,角柱下端插入地檻之平榫已破壞,唯不影響結構安全;走道外圍之廊柱表面有風化現象,其下端埋入混凝土基墩之部份,均有腐朽發生。
位於六龜研究中心之倉庫,建於1950~1960間,2005年拆除,中柱式三角桁架構成人字屋頂,座北朝南,室內面積約140 m2(平方公尺)。混凝土地基上為高27cm之勒腳牆,其上為塗煤焦油之紅檜地檻,室內為混凝土地面無地板構架。柳杉屋柱及間柱以平榫插入地檻,塗柏油之柳杉板材為雨淋板,無內壁板及天花板。屋頂構架內為八個三角桁架,由檁條連結,檁條延伸至南北二端由瓜柱支撐,再覆以縱向柳杉望板、油毛氈、及鐵皮浪板。全棟除地檻外,全部構材(屋柱、間柱、桁架等)受白蟻嚴重侵襲,可輕易以木棍刺穿。防護措施有塗煤焦油、耐腐性強之紅檜地檻,於屋角相交之雨淋板有鐵片防護,及封簷板保護檁條端部。拆除時除全棟受白蟻侵襲外,雨淋板雖外塗柏油,但大部分已消退,導致春材部分風化嚴重、且有節處大部分脫落。