在農業生態系中，環境因子與農業生產、能量與元素循環息息相關，我們監測環境項目可分成3大類：

1. 氣候：溫度、濕度、日照、降水等氣象資料，及溫室氣體等
2. 土壤：土壤溫度、田間含水量、電導度、土壤有機質、元素等
3. 水田間滲漏水量、氮素淋洗量

由於各項環境因子在時間與空間尺度變化有不同的周期，短則為日、長則為數十年，因此需要長期累積資訊以瞭解其所代表的訊息。長期的研究成果可以應用在模式的構築與預測，讓我們更能理解農誒生態系在未來可能發生的變化以及面臨的問題。近年由於資通訊科技日益發達，許多環境監測已可遠距(remote)進行並自動記錄。

#圖：水稻田中的土壤自動監測系統