香莢蘭花朵構造如同一般的蘭科植物，有1個上萼片(dosal sepal)、2個側萼片(lateral sepals)、2個花瓣(petals)、1個唇瓣(lip or labellum)及合蕊柱(column or gynandrium)，香莢蘭為雌雄同花，合蕊柱中包含了雌蕊的柱頭及雄蕊的花藥，花藥位在合蕊柱頂端，花粉位於花藥蓋內側，花粉粘合成一個團塊稱為花粉塊(pollinia)，在雌蕊和雄蕊之間有一片膜狀的蕊喙(rostellum)將兩者隔開，因此無法自行授粉，只能依靠人力來幫助授粉，授粉的成功與失敗也會直接影響到香草莢的產量，甚至直接關係到農民和香莢蘭產業整年的收益狀況。

香莢蘭花朵構造。

授粉時花粉塊、蕊喙與柱頭相對位置及示意圖