魚塭在無水車、止水的狀態下會造成溫度分層的現象，此與氣候也有相當大之關係，假設連日天氣晴朗，淺坪式魚塭因水深較淺，白天日光直接照射至底層，底層底土經日照累積熱量，至夜間因表層水溫冷卻散熱較快，反之底層底土累積熱量水溫冷卻散熱較慢，因而造成其水溫底層較高而表層較低之現象，若連續陰天而突然放晴則造成底層溫度較低、表層溫度較高之現象。