台北植物園的蓮花池角落有棟木造平房，為日本殖民時代昭和初期(1930)所建築。這棟建築曾做為林業試驗所宿舍，時光荏苒，木造建築歷經借宿人退休凋零後，逐漸荒廢為人淡忘；本園在郭中端和堀込憲二兩位設計師的協助下，恢復其舊有日式建築的樣貌，並增添日式枯山水庭園，讓民眾得以一窺其往日之風華。

       此建築外觀與臺灣各地所保留下的素雅日式建築相似，建築內部以Ｌ型的土間（doma）將中央的和室圍起，和室（washitsu）採日本傳統的代表樣式「書院造」 （shoin-zukuri）設計：兩間各為六畳，畳（tatami）即榻榻米，為鋪設的厚蓆墊；內間和室由招待賓客的「座敷」（zashiki）及家人自用的起居室「居間」構成。「座敷」一側內凹的壁龕稱為「床間」（tokonoma），用於擺設家戶象徵及珍貴收藏，其旁有「床脇」（tokowaki），具備更多擺飾及收納空間。當使用空間不足時，拉開座敷與居間中間的厚紙門－「襖」（fusuma），便可擴大面積。此外，其外牆使用日式雨淋板（下見板），防風雨功能極佳。

1. 犬走り（いぬばしり）：屋簷下的台基

2. 土間（どま）：與室外地面同高的室內起居空間

3. 上り框（あがりがまち）：進入和室的木階

4. 和室（わしつ）：日式的起居室

5. 畳（たたみ）：榻榻米，厚的草蓆墊子

6. 床柱（とこばしら）：壁龕的裝飾柱，家庭的象徵宗柱

7. 床の間（とこのま）：座敷內放置壁龕的空間

8. 床脇（とこわき）：床柱另一側凹入的壁間，用於擺設家內裝飾品的展示及收納空間

9. 襖（ふすま）：厚紙拉門，可區隔空間及阻隔聲音、光影

10. 濡れ縁（ぬれえん）：廊下的空間

11. 戶袋（とぶくろ）：收納雨戶的櫃子

12. 雨戶（あまど）：防風雨用的木板門

13. 障子（しょうじ）：窗格拉門

       枯山水（karesansui）又稱禪花園(Zen Garden)，多以堆疊有致的石塊代表「山」，並以大片面積的淺色碎石表現「水」；此外幾乎不使用鮮豔的開花植物，這些靜止不變的設計元素有助人達到寧靜的心靈狀態。這類庭園的管理者，必須每日持木耙以修行般緩慢的速度，在碎石上拖曳出反射內在心境的水波圈線，搭配著素雅的苔蘚，草坪及綠葉植物造景，為日本佛教寂靜空靈的禪學觀的極致表現，本園的這座造景還包括遠山及特意設計的龜、鶴二小島。