為兼顧漁民生計並使部分來游鰻苗得以溯河成長，農業部經邀集產官學界代表召開會議研商並取得共識後，於 102 年 9 月 9 日公告「鰻苗捕撈漁期管制規定」，期藉該管制措施在兼顧產業及資源永續前題下，讓部分鰻苗得以溯河洄游成長，增裕鰻魚資源。

「鰻苗捕撈漁期管制規定」於102 年 9 月 9 日公告發布，其規定重點如下：

一 . 每年自 3 月 1 日至 10 月 31 日止，禁止於距岸三浬內海域、潮間帶及河口水域以任何方式捕撈鰻苗。

二 . 於花蓮縣、臺東縣海域、潮間帶及河口水域捕撈鰻苗或基於學術研究目的，經中央主管機關核准者，不受前揭規定限制。

除了管制鰻苗捕撈，讓部分鰻苗得以溯河洄游成長，增裕鰻魚資源外，為了讓鰻苗成長為性成熟之成鰻，並使成鰻得以降河產卵，同時輔導 13 直轄市及縣（市）政府依漁業法規定公告轄屬至少一條河川之中下游流域，全年禁止以任何方式捕撈鰻魚 （禁捕鰻魚河川彙整如附圖） ，尤其宜蘭縣更公告全縣境內河川全流域禁止捕撈鰻魚，以進行鰻魚棲地保護工作。

113年度為期4個月的鰻苗捕撈漁季於11月1日展開，籲請從事岸際捕撈鰻苗業者應向作業當地區漁會辦理登記，於作業期間維護自身安全，配合於漁撈日誌協助填報捕撈方法、捕撈地點及捕撈數量，並於卸魚申報系統完成申報，以利鰻魚資源管理評估及規劃。

(詳見農業部漁業署公告之鰻苗捕撈漁期管制規定)