全球的海草數量持續在減少，台灣也無法倖免。如澎湖鎮海灣為台灣周邊海域海草面積範圍最大，可達113公頃，水試所澎湖漁業生物研究中心在2020年調查時已流失萎縮僅剩近40公頃。
本所澎湖中心有鑑於海草床流失日益嚴重，於2011年即著手澎湖海草種類與分布調查，共記錄到5種海草，並將海草復育先鋒部隊-卵葉鹽草、海草復育正規軍-單脈二藥草及海草復育友軍-甘草等3種海草，組成「澎湖海草復育特攻隊」，於 2014年以將這3種海草以「根狀莖法」混植的方式，移植了60m2，至2024年這支澎湖海草復育特攻隊成功拓展至近5,000m2，為國內首次進行海草床的復育並成功。不僅增裕了漁業資源，亦應用遠海梭子蟹蟹苗的放流，且大幅提高這些蟹苗活存率。