海草種子的散布可加速海草族群的擴散，而大型海草的果實與種子容易採收，如澳洲海神草屬（Posidonia）的海草種類就可藉由種子的撒布進行復育。但臺灣周邊沿岸的8種海草以泰來草種子較大，但生長分布範圍侷限於偏熱帶的屏東，不易應用於臺灣各海域。而全臺主要的分布種以卵葉鹽草、甘草及單脈二藥草的種子又偏小，在蒐集海草果實與種子的過程中，對海草床的擾動大。

加上海草種子萌芽時間長，以卵葉鹽草為例，從種子萌芽到長成海草苗，至少約需2個月以上的時間，育苗成本高，人工種苗移植至野外後，對環境的適應如潮汐與水溫的劇烈變化仍具有相當大的挑戰，使種苗外移活存率偏低。

2024年本所澎湖中心近年在港子海草復育區針對所復育的海草床發現，以無性生殖的方式進行海草移植時，可迅速長成海草床，並形成種子庫，同時再透過種子的傳播，不僅提高無性生殖基因的多樣性外，也讓所復育的海草床面積快速增加。大幅降低以種子育苗的成本，使海草床的復育更具有效率。