近幾年來，海鱺箱網養殖的發展過程中，發現到一些困難點，極待早日解決。如在陸地上：仔魚第一次攝餌之餌料適口性問題；魚塭培育魚苗的過程中，容易被卵圓鞭毛蟲感染，造成高死亡率；其他尚包括魚虱、魚蛭及淋巴囊腫病等問題。而在海上養殖的過程方面：容易感染鏈球菌及發光菌造成大量死亡；或因密度太高導致白肌蟲的寄生，使海鱺眼睛白濁化、發生眼盲的現象，而無法正常攝食，導致體瘦，喪失商品價值，為整個產業發展的瓶頸。海鱺箱網養殖為現今養殖漁業發展的主要重點，如何獲得健康優良海鱺苗是提高養殖成功率的關鍵之一。