配合雜草萌芽及繁殖的生態特性，以及作物栽培方法，將非化學性的雜草綜合管理分為「作物種植前之防治」及「作物種植後之防治」(表2)。種植前宜盡量減少土壤中雜草種子的數量，種植後需於雜草開花之前防除雜草，避免種子及繁殖器官的產生，將可大幅降低下期作物雜草的危害。可分別選用以下適合之方法，進行綜合管理：

(一)、作物種植(移植)前之防治：

1.預防性：選用乾淨作物種子、無雜草種子的肥料及栽培介質。

2.輪作、間作：淹水、水旱田輪作、與含剋他物質的植物或綠肥輪作或間作。

3.覆蓋及高溫：無孔塑膠布覆蓋土面，利用遮陰及高溫殺死剛萌芽一年生雜草。

4.覆蓋：作畦後覆蓋塑膠布、稻稈、稻殼，及含剋他物質的植物殘體等植材，預防鄰近雜草種子飛散至田區。

5.耕犁：利用二次耕犁方法，翻耕淺層土壤，使多年生雜草的走莖、塊莖裸露土表，易於移除，同時土中雜草種子開始萌芽，形成小苗後進行二次耕犁，即可大幅降低淺層土壤中雜草的危害。

6.生物性除草：混拌玉米蛋白粉於土表：抑制闊葉型雜草萌芽。

(二)、作物種植(移植)後之防治：

1.人工除草：使用鋤頭、鎌刀或徒手移除雜草。

2.中耕除草：中耕培土將雜草埋入田土中。

3.機械割草：使用背負式或乘坐式割草機降低雜草高度或抑制雜草正常生長。無法有效防除多年生雜草的走莖和塊莖。

4.生物性除草：施用剋他化合物抑制雜草生長。

5.草生栽培：於坡地、多雨區、土壤侵蝕嚴重地區果園，選留自生性適用雜草，形成複合式草相的地被植物，兼顧抑草及水土保持功效。

表2. 非化學性之雜草綜合管理方