木黴菌 (Green mould)
學名：Trichoderma sp.

病原生態：
　　當木黴菌與與香菇菌絲接觸時，會產生拮抗線，而迫使香菇菌絲停止生長，且幾乎所有木黴菌均有此現象，其培養液也有相同作用。木黴菌屬於不完全菌，其有性世代為Hypocrea sp.，孢子堆為黃綠色到暗綠色，其可危害香菇菌絲及子實體，在低溫時發生較輕微。當香菇生長勢強時，本菌雖可附著，但不發芽，一旦香菇菌絲生長勢弱時，且遇高溫且氧氣不足甚至香菇菌絲死亡時，則本菌可擴大危害及產孢。木黴菌普遍存在於香菇栽培場舊段木、木屑包及死亡的菇體，而菌種也是其感染源之一。本菌平常以孢子傳播，但當基質水份含量高時，則可以發芽成菌絲以吸收養份再繁殖，當水份少時則又可形成孢子。當灑水時孢子即可藉水滴傳播，亦可藉風或人力傳播，其發芽率極高，是香菇栽培之最嚴重之初期病害。

防治方法：

紅麵包黴菌 (Red breadmould)
學名：Neurospora sp.

病原生態：
　　本菌因其對木屑之腐朽能力極弱，尤其是米糠使用量多時，更易發生。感染時在菌種瓶內、塑膠袋內、棉花塞周圍或塑膠套上產生桔紅色的分生孢子，有時亦可突破塑膠袋產生。其可迅速蔓延，對菌種及木屑包之危害極大，本菌發生後會使得菇類菌絲生長勢減弱或全部死亡。除了在香菇木屑包發生外，亦可危害其他以木屑栽培之菇類。本菌主要以無階段之Monilia sp.的分生孢子危害。其菌落最初為白色，很快地變為淡黃色，菌絲生長疏鬆、絨毛狀，可蔓延生長。成熟後大量產生桔紅色孢子，再菌絲上形成一層團塊狀的桔紅色孢子團，是該菌一個重要的特徵。其菌絲生長疏鬆，呈綿絮狀，孢子表面有脈紋，分生孢子常串生於氣生菌絲頂端成分叉鏈狀，故又稱為鏈孢黴，又由於分生孢子呈桔紅色，且又常在含澱粉之食物上出現，尤其是麵包上，故又稱為紅色麵包黴菌。本菌可產生大量桔紅色的粉狀孢子，隨著空氣的流動，到處飛揚，傳播而污染環境，且可經由昆蟲及工作人員之手、衣物等到處傳播，反覆感染，造成大規模的危害。在高溫多濕的環境下，本菌生長極快，一般約2～3天可完成一個世代。

防治方法：