屬真菌、藻菌綱、卵球菌亞綱、露菌目、腐霉菌科。以Phytophthora palmivora為代表，菌絲在PDA生長較緩慢，形成密緻﹑略帶放射狀之白色菌落，氣中菌絲稀疏或無。培養於V-8 培養基上時，胞囊串生於胞囊梗上，有時可長達二﹑三十個；胞囊呈橢圓形﹑卵圓形﹑或長橢圓形，兩側對稱，有顯著之乳頭狀突起，胞囊大小平均約 33-55 X 23-35 μm，長寬比平均約1.3-1.9；胞囊脫落性，有短梗 (Pedicels)，梗長約5μm。易形成球形的厚膜胞子，大小約25-35μm。為異絲型，經隔膜對峙培養產生之卵胞子為球形，直徑大約為 28-37μm；藏卵器表面光滑，大小約 33 - 44μm；藏精器單室﹑底著，大小約10 - 17 X 13 - 20μm。菌絲之可生長溫度，最高為 34-35℃，最低為 8-10℃，最適溫約在 24-30℃。

病徵：
　　靠近地面之果實較易被感染。罹病果實表皮，初現褐色水浸狀斑點，病斑迅速擴展，3-4天後即可佈滿1/3的果實表面，此時果實轉黃，掉落地面。罹病果實不軟化，但產生特殊之霉腥味。濕度高時，果實表面有時會長出白色霉狀菌絲。

發病生態及時期：
　　適溫高濕（20－25℃，相對濕度90％以上時）之環境適合發病。果實褐腐病在連續降雨、或颱風侵襲後易發生，嚴重時可造成未防治之柳橙園50％以上之果實落果。中南部地區之褐腐病多發生於每年八至十月，北部地區在冬春季陰雨棉棉時發病較嚴重。柑橘品種中柳橙、晚侖西亞（香丁）、溫州柑、檸檬、來姆、葡萄柚、柚類均甚感病，椪柑等寬皮柑較抗病。
　　疫病菌平常靠菌絲或厚膜胞子存活於柑橘根系、土壤或植物殘體中，等降雨或灌溉、澆水致土壤濕度飽和時，病菌形成胞囊及游走子。游走子可在水中游泳，並藉風雨吹送、或昆蟲、小動物等攜帶至果實，侵入感染，誘發病害。

防治方法：