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丹參種植期間鮮少有病蟲害發生，田間之調查結果僅少數有線蟲、斜紋夜盜蟲及疫病等病蟲害為害情形發生。在沙質土含量較高之土壤，或是以根部扦插作為繁殖時，會有線蟲為害之情形，因此，在選擇栽培土壤時儘量避免種植在沙質土，或者在種植前二週施用蝦蟹殼粉及篦麻粕，每公頃施用量為600公斤，將蝦蟹殼粉及篦麻粕均勻攪拌於田區土壤中，可降低線蟲之為害。斜紋夜盜蟲為害丹參之基部，田間防治可施用蘇力菌，可有效防治斜紋夜盜蟲之為害。疫病在丹參田間高溫多濕的環境下會引起，防治時以亞磷酸稀釋500-1000倍處理,可降低疫病之為害。