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如何評估一個混農林系統是否符合永續經營? 根據監測和觀察資料，並且收集過去的文獻資料，以及對當地社區、林農的深入調查，初步針對山地混農林系統永續經營的指標提出下列的建議，可做為未來評估相似混農林系統的永續性的一個依據。
我們將這些指標分為三個主要層面來評估，包括：環境面、經濟面和社會面。

環境面：
1) 自然保護：生物多樣性及種群數量、水資源供給以及溫室氣體排放等；
2) 污染防控：農藥、化肥使用率及二者在土壤水分中的殘留等；
3) 環境規劃：土地佔用比例、道路比例等。
經濟面：
1) 清潔產品：有機耕作面積、耕作土地比例、混農系統面積比例等；
2) 勞動力：勞動生產力指數、社區失業率等；
3) 收入：混農林產品價格、人均年收入、低收入家庭比例等；
4) 綠色產業：生態旅遊遊客人數。
社會面：
1) 人口和健康：人口密度、城市流動人口返鄉數量、人口結構變化；
2) 公共參與：混農林業社會參與度、混農林事務社區參與積極性；
3) 宣傳：混農林業推廣的財政支援、技術支援。