草魚耐鹽性狀之全基因體關聯分析研究

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農學報導

草魚耐鹽性狀之全基因體關聯分析研究

刊登日：115/08/19

文章來源 : 農業科技決策資訊平台 2026-08-19

草魚耐鹽養殖研究背景

　　隨著淡水資源日益有限及鹽鹼地水域開發需求增加，發展適合鹽鹼環境養殖的魚種已成為水產產業的重要方向。草魚是全球重要的淡水養殖魚類之一，過去研究顯示其具有一定程度的耐鹽能力，在低鹽環境中仍能維持生長，甚至展現較佳的肉質表現。因此，若能培育具耐鹽特性的草魚品系，將有助於擴大養殖水域利用範圍，提升產業競爭力。

全基因體關聯分析如何篩選耐鹽遺傳變異

　　中國水產科學研究院珠江水產研究所團隊以草魚為研究對象，透過全基因體重測序與全基因體關聯分析（GWAS），探討耐鹽性相關基因標記，此研究以948尾平均體重約14.6公克的草魚進行鹽度逆境試驗，將水體鹽度逐步提升至12‰，並以存活時間作為耐鹽能力評估指標。研究人員從存活時間最短與最長的個體中，各選取50尾作為耐鹽敏感組與耐鹽組，進行GWAS。結果共獲得約475萬個高品質SNP標記，並利用GWAS分析篩選與耐鹽性相關的遺傳變異。研究發現共有32個SNP位點與耐鹽性狀達顯著相關，分布於11條染色體上，顯示草魚耐鹽性並非由單一基因控制，而是受到多個基因共同調控的複雜數量性狀。

候選基因在耐鹽能力中的角色

　　進一步分析顯示，與耐鹽性最相關的基因包含了traf3ip2a、trpc3及loc127502916。其中，traf3ip2a參與免疫反應與細胞壓力調節，在耐鹽個體中表現量較高，推測有助於提升逆境適應能力；trpc3則與鈣離子訊號傳遞及滲透壓調節有關，研究發現其相關位點多次出現在顯著區域內，顯示其可能是草魚耐鹽能力的重要調控因子。此外，loc127502916可能與荷爾蒙調控及離子平衡維持相關，對魚體適應高鹽環境亦具有潛在影響。研究結果也顯示，不同基因型個體在高鹽逆境下的存活時間具有顯著差異，驗證了這些基因與耐鹽能力之間的關聯性。