以eDNA追蹤瀕危魚種
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文章來源 : 農業科技決策資訊平台 2018-11-16
eDNA又稱為環境DNA (environmental DNA)，是生物遺留在環境中的遺傳跡證之一。多數研究利用追蹤生物遺留在環境中的DNA，推估特定環境中生物多樣性(biodiversity)及豐富度(abundance)，透過eDNA的採樣將能達到族群現況評估及未來保育的目的。
美國馬里蘭大學環境科學中心(University of Maryland Center for Environmental Science)與史密森環境研究中心(Smithsonian Environmental Research Center)共同研究以eDNA追蹤美國馬里蘭州乞沙比克灣(Chesapeake Bay)中鯡魚的數量。鯡魚是北美地區傳統捕撈魚種，也是當地生態系食物網中許多掠食者主要的食物來源，該物種的族群大小對當地生態系平衡扮演重要的角色，但由於1970年代以來過度捕撈及產卵地被破壞下，現已成為受威脅物種，如何保育該物種成了當地機構研究的重點之一。
研究團隊藉由檢測水域中目標鯡魚遺留在環境的粒線體遺傳片段，並以即時聚合酶鏈式反應(qPCR)將特定片段擴增，以擴增的數值結果量化族群大小及鑑識魚種，藉此能有效評估不同鯡魚族群的豐富度及棲地利用程度，達到監控的目的。與傳統架設漁網捕撈相較下，採集eDNA以分子生物學的方式將大量節省人力及物力資源，即可獲得目標物種的遺傳資訊，推估物種可能的有效族群量及產卵地。研究團隊調查橫跨12處支流，在馬里蘭州境內196個地點採集水樣，發現境內的灰西鯡分布在東岸流域，而西岸已開發流域多為藍背西鯡。【延伸閱讀】藉探索海洋DNA一窺海底環境的奧秘
該研究是自1960年以來，首次在乞沙比克灣流域大規模採樣eDNA進行鯡魚物種及族群方面的生態研究。該研究成果已發表在PLOS ONE期刊，研究結果將有助於當地鯡魚捕撈計畫的擬定及規劃相關保育策略。
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