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依據十字花科蔬菜穴盤幼苗各個生育階段的生長生理特性，將幼苗管理區分為四個階段。第一階段是從播種至初生根突破種皮(亦就是所謂的發芽)。第二階段為種子發芽之後，下胚軸伸長，頂芽突出介質，子葉展平。第三階段是本葉(真葉)的生長發育。第四階段為幼苗移植期。以下分述各個生育階段的管理要點。

(二)第二階段
當種子發芽後，迅速將其從黑暗的催芽環境移置陽光充足的育苗室，等待子葉出土。在陽光充足的環境下完成子葉出土生長階段，幼苗的下胚軸短又壯，是生產矮壯幼苗的要點之一。種子在黑暗環境下發芽之後，若延遲將其移置在陽光充足的育苗室，讓子葉出土生長階段在黑暗環境下進行，則造成下胚軸徒長，將影響後續的生長發育與管理作業，降低幼苗品質。
穴盤育苗第一階段與第二階段，種子發芽與子葉出土生長期，其生育階段的環境條件完全不一樣，若不加以注意，即讓下胚軸徒長，徒長的下胚軸很脆弱，稍有不慎即有折斷的危險。請務必細心調節種子發芽與子葉出土生長期的生育環境，以利往後成長期的生長發育。