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第三階段為幼苗本葉(真葉)期的水分與養分管理，本葉生長發育期間，隨著葉片的增加及增大，其生長所需的水分及營養濃度亦隨著增加，過與不及均不利於幼苗的生長及發育。水養分管理不當，除了幼苗地上部生育受影響之外，幼苗根的發育與吸收功能均水影響。水分管理重點為，於生育期間維持介質中的水分平衡，避免忽乾忽濕影響根的發育與吸收功能。營養管理重點為，隨著幼苗本葉發育而逐次增加肥料濃度，肥料種類以氮素含量較低的配方為宜，以減緩葉面積的快速生長，幼苗第1 - 2片本葉期之施肥種類與肥料濃度為，N-P-K=15-10-30，2000倍稀釋液，第2 ~ 3片本葉期，增加至1500倍。