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炭疽病為潛伏感染病害，普遍存在每一個紅龍果果園，為採果後之重要病害，全台每個果園平均出現炭疽病之發病率為七成，嚴重影響果實儲架壽命。
病原菌學名：Colletotrichum gloeosporioides （佔炭疽病發生比例之70%）， C. truncatum （20%）， C. boninense 及其他Colletotrichum spp. （約10%）
病徵：病原菌偶而感染莖部，主要為害成熟的果實。莖部少有發病，病兆為黑褐色或紅褐色凸起之小斑點（圖21）或再擴大為黃褐色腐爛病斑；不同種之炭疽病在果實上的病徵稍有差異（圖22，23，24），大致上自鱗片底部或果梗發病，初期出現凹陷褐色小斑點，病斑會繼續擴大，接著病斑中央出現黑褐色針狀產孢構造，在潮濕的環境下會產生粉紅色分生孢子堆，或子囊殼，擴及果實全部組織，造成嚴重之果腐（圖25）。
發生生態：病原菌以分生孢子為主要感染源，藉風雨傳播。病菌平常存活於莖部病斑、枯死莖組織、或地面植株殘體上。在降雨、露水等適溫高濕環境下，病菌在殘體上形成分生孢子堆，長出大量的分生孢子，成為初次感染源，靠雨露傳播，侵染幼嫩與受傷的組織，但被感染的組織不會立即發病，要等到果實成熟採收後才會出現病徵，稱為潛伏感染。病原菌可感染任何發育期的果實，只是果實未成熟時不會出現病斑：病原菌分生孢子附在表皮組織上後，當有水膜的情況下，於適溫下4小時即可發芽並形成附著器，24–72小時以侵入釘穿透表皮，但即靜止不作進一步發育，直至果實成熟後才開始生長形成病斑。炭疽病菌之寄主範圍甚為廣泛，可以為害多種果樹與其他作物，包括檬果、木瓜、酪梨、草莓等，因此病原菌的初次感染源亦可能來自其他鄰近作物。
防治方法：
1.田間衛生：清除罹病之枝條及果實，並予以燒毀，以降低果園中病原菌之密度；修剪雜草，去除可能之替代寄主。
2.適當施肥與整枝修剪，使通風良好、日照充足，增強果樹抵抗力。勿施用不當藥劑與植物生長素，降低植物抵抗力。
3.藥劑防治：目前植保手冊推薦之防治藥劑如下，可選擇幾種藥劑輪流使用。包括：325g/L亞托待克利水懸劑3,000倍、70%甲基多保淨可濕性粉劑1,000倍、23.6%百克敏乳劑3,000倍、40%克熱淨（烷苯磺酸鹽）可濕性粉劑1,500倍、25.9%得克利水基乳劑1,500倍、80%免得爛水分散性粒劑500倍、50%三氟敏水分散性粒劑4,000倍、62.5%賽普護汰寧水分散性粒劑2,000倍、23%亞托敏水懸劑2,000倍。此外，可於無果期，整枝修剪後，全株噴布4-4式波爾多液1–2次，降低果園中病原菌之密度。