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香草莢種子細小，呈卵形，一個果莢種子平均3-5萬粒，成熟種子為黑褐色，大小約為0.25×0.20公厘。香莢蘭種子約在授粉後21-28天受精，受精後胚囊開始發育成種子，在授粉後30天幾乎皆為剛剛開始膨大的白色胚囊，授粉後45天已有部分種子種皮轉為淡褐色，授粉後60天以有多數種子種皮轉為黑色，授粉後75天時大多數發育正常的種子都是黑色，少數白色或淺褐色的種子為敗育。
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1.飽滿的香草種子 |
2.成熟香草莢會裂開，果莢內有數萬顆種子 |
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3.受精不佳的果莢種子稀少 |
4.受精不佳的果莢種子稀少，大多數胚囊敗育 |
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5.顯微鏡下可以看到受精不佳的果莢種子稀少，有許多未發育白色的胚囊 |
6. 顯微鏡下受精良好的果莢種子飽滿 |
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