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狼尾草是國內主要芻料作物之一，為因應氣候變遷，期望育成具有逆境忍受性的品種，以維持穩定的牧草產量供應。狼尾草台畜草四號（TS4）、六號（TS6）及八號（TS8）以扦插苗種植生長3週並淹水7天，就地上部高度下降比例而言，以四號最高（30.4%），六號次之（24.8%），八號最低（13.5%）。在淹水處理下，粗蛋白質、磷、鉀及鈣含量在四、六及八號3個品種皆達顯著性的下降，其中四號之粗蛋白質含量降低比例高達55.3%，六號達41%，八號最低為35.8%；而水溶性碳水化合物含量在3品種間則均有顯著性的增加，與對照組比較下，四號及八號約增加3倍，而六號約增加2倍，另八號之中洗纖維與酸洗纖維含量在淹水處理與對照組間均未達顯著性差異。綜合上述說明，八號在淹水逆境的耐受性表現較四號、六號佳。然轉錄組定序分析（RNA-Seq）結果顯示，在對照組與淹水處理間，狼尾草台畜草四號具顯著差異性表現基因（Differential Expression Gene, DEG）共18,980個，六號之DEG共15,486個，另八號之DEG則有18,007個。綜合上述，四、六及八號之DEG以在淹水處理下表現量降低者占多數，且藉由比對COG（Cluster of Orthologous Groups of Proteins）資料庫，說明該顯著差異性表現基因所代表的蛋白質，其功能分類大部分與訊息傳遞、轉譯後修飾、碳水化合物及胺基酸之轉運與代謝、二次代謝物之生合成與轉運等機制相關。