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施肥是提高果實產量、品質與維持地力的重要方法，但並不是多施肥就一定會有好的效果，不適當的施肥，除了可能造成無謂的浪費增加成本支出以外，也有可能會因此而造成果實品質降低的不良後果，嚴重者甚至會形成植株的毒害。因此，審慎合宜的肥培管理，才能以較低的支出獲得適當的收益。首先，應先大致瞭解肥料主要成分的作用：氮肥以氮素（N2）表示，與枝葉的生長有密切的關係，氮肥過多則枝葉過於繁茂，枝梢生長強勢且葉片濃綠，但會影響小果的著果數與降低文旦柚果實的品質。磷肥以磷酐（P2O5）表示，對植物的生長具有重要的影響，並且可以促進果實的成熟；值得注意的是，磷肥在土壤中的移動性很差，若將其灑施於土壤表面，則植物的根並不容易吸收得到。鉀肥則以氧化鉀（K2O）表示，對碳水化合物的合成與移轉關係密切，亦即對於果實的品質具有相當的影響。由主要肥料成分的作用特性可以明瞭，在果實生長發育的期間，應特別注意減少氮肥與增加磷肥、鉀肥的施用， 良好的肥培管理，可提升作物的產量與品質，提供作物適合的生長環境。文旦柚果園的合理化施肥可先從土壤與植體營養分析做起，藉由土壤分析診斷的資料，可以瞭解土壤酸鹼值、有機質與營養元素含量，再進行適當的調整；而植體分析的結果則可直接顯示果樹的營養狀況，瞭解各類營養元素是否適當、過多或不足。就好像生病看醫生一樣，都需先檢查到底生得是什麼病，然後才能對症下藥，營養分析的作用也就是如此。土壤與植體營養分析的取樣對象，分別是果園內的土壤與果樹上的葉片。進行營養分析的適當時間是在每年的8月中旬至9月中旬，有關檢測樣品的取樣方法與檢驗分析，以及後續的土壤調整策略，可洽詢各區農業改良場土壤肥料研究室；一般而言，文旦柚果園土壤pH值的適宜範圍為5.5～6.5之間，土壤有機質含量應在2％以上。而文旦柚果樹葉片營養元素濃度之適當標準，可參考林慶喜先生依據台灣省農業試驗所及日本診斷基準所定下的範圍，若葉片氮、磷、鉀含量低或高於適宜範圍者，建議按其慣用施肥量增或減1/6～1/2不等；或可依土壤肥料研究室之專業建議進行。 柑桔類果園的施肥時期可區分為「採收後至春芽萌發前」、「開花至著果」以及「果實發育期」三個時期，文旦柚屬於柑桔類果樹的一種，可依據上述的時期劃分進行施肥。但由於文旦柚是於9月採收，此時溫度仍高，植株吸收養分的能力尚強，此時亦較不適合進行開溝掘穴等深層施肥。因此「採收後至春芽萌發前」的施肥或可區分為禮肥與基肥，禮肥在果實採收後即施用化學肥料以求肥效，而在冬季時深施基肥與進行土壤改良。基肥的施用種類以有機質肥料為主，若施用纖維含量較高、氮磷鉀含量各約為1％之有機質者，可以多量施用，每株文旦柚果樹可施用30公斤以上；而若是含氮量偏高的豆粕類有機質，則每株僅以少量施用（3～5公斤）為宜，以免造成植株根系受到傷害或形成氮肥偏高的現象。另外由於有機質肥料肥效的緩效性與累加性，在選擇有機質肥料種類時應需注意其三要素的含量與比例，特別是氮肥偏高的文旦柚果園，對於豆粕類有機質肥料（如豆餅）的使用，需格外留意。基肥的施用以深施為宜，以條溝狀或穴狀開挖土壤，肥料並應與土壤充分混合後施入並覆土。而來年的春季與夏季的生育期間，施用化學肥料以促進植株生育與提高果實品質，並可採用撒施的方式進行以節省成本。由於夏肥為果實發育充實期間，施肥應以磷鉀肥為主，氮肥用量宜少或完全不施，以免不當誘發夏梢生長，進而與果實競爭營養。在果實採收之後，果園應再次灑施化學肥料以恢復樹勢，稱之禮肥。由於果樹的適當施肥量會因樹齡、結果量、土壤質地肥力與植株生育狀況而異，因此除了依據柑桔果園施肥推薦量為基準，還需針對上述的條件綜合判斷並調整用量。一般而言，成樹每年約施用氮素1公斤、磷酐0.5公斤與氧化鉀0.7公斤。茲將農委會編印之作物施肥手冊中，關於柑桔果園三要素的推薦量以及施肥時期及分配率摘錄於後。 註： 1.如施用10～20公斤之豆粕類有機肥（含氮素5％以上），則化肥氮素需減施350～700公克。 2.採收後之施肥，除化學肥料外，為維持地力，應另行施用有機肥料，可施用腐熟堆肥35公斤以上。 3.礫質地或粗質地肥分易流失之土壤，施肥量增加30～40％，細質地保肥力佳之黏質壤土可酌量減施20～30％。 4.草生耕種法之柑桔園，春肥及果實發育期之氮肥宜增加20～30％。 5.在土壤較肥沃之果園，若春肥及果實發育期均用台肥5號，或春肥、果實發育期氮肥過多，將影響果實品質和著色，以及12月之花芽分化，故採收後之肥料應改用台肥2號代替。 6.4～8月間若雨量豐沛，則果實發育期之氮肥宜減施或免施，以免夏秋梢過於旺盛。