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中耕可以調節土壤通氣性，改善田間水分狀況，促進有益微生物活動，及加強有機質分解供植株利用。小米於生育期可中耕3次，於幼苗期、拔節期及孕穗期進行。因所需人力成本高，故一般生產僅中耕1次。中耕於播種後約25~30天進行，同時行除草及間苗，行間雜草則可以小型行間除草機進行防除，此時可視土壤乾濕程度酌予灌溉並進行施肥。小米收穫後~播種前，應保持田間環境整潔，於雜草開花結籽前定期翻耕，減少雜草種子密度，以利後期管理，或可種植綠肥，避免雜草叢生，且有提供田區有機質，改善土壤性質之優點。小米的種子較小，幼苗生長緩慢，生育初期易受雜草影響，雜草防除為播種後保持及提高幼苗成活率的重要措施。第1次除草可配合中耕、間拔進行之，間拔後，植株間有適當生長空間，抽高迅速，生長勢強於雜草，故後期可不用進行雜草防除，或可視田間植株生長情況再行1~2次防除即可。