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水稻有機栽培是屬於高技術栽培，栽培過程環環相扣。

1. 栽培地點應避開環境汙染。
2. 栽培品種應選擇適栽品種，稻種來自無污染之採種田種子。
3. 育苗過程應充分進行溫湯消毒工作，培育健壯秧苗。
4. 培育健康肥沃之土壤，可以讓水稻永續經營。
5. 水田整地宜平整，以利栽培管理。
6. 秧苗移植支數及插秧密度應適當，可以有效控制病蟲害。
7. 田間雜草應有效控制，避免與水稻生長競爭，影響水稻生育。
8. 有機質肥料應合理化施用，可以穩定產量及降低病蟲危害。
9. 施用有機資材防治高密度的病蟲危害，仍是必須施用的手段。
10. 水分供給與水稻的生育關係最密切，必須適時適量進行灌排水管理，避免環境逆境對水稻造成不利之影響。
11. 適當時間收穫，可以穩定水稻產量並提升稻米品質。

水稻是國內最基本的栽培作物，相關技術已經有完整的研發及推廣，配合國內近幾年對於有機栽培相關技術之研發，為最容易入門之有機栽培作物。