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常見的荷花及睡蓮如何分辨？茲就其各部位形態敘述如下：
- 葉：
荷(蓮)葉為圓盾狀、全緣，葉柄圓柱形密生小刺，成熟葉片挺立出水，稱為立葉，葉緣具些許波浪狀，故有「荷葉邊」之形容詞，但生育初期的荷葉亦可能浮於水面，稱為錢葉及浮葉，不過，荷葉的獨特之處是表面具極其細微的角質乳突，觸摸有粗糙感，水濺其上，立即凝為大小水珠，滾動而不沾濕荷葉，此為著名之蓮花效應(lotus effect, 或稱荷葉效應)，是大自然中名副其實的奈米科技！睡蓮葉片則貼緊水面生長，其葉緣為鋸齒(熱帶睡蓮)或圓滑(耐寒睡蓮)。
- 花：
荷花花朵為單生、兩性花，由花萼、花瓣、雄蕊群、雌蕊群、花托、花柄等組成，其中花托即我們常見之蓮蓬，呈倒圓錐狀，包覆著後續會發育成蓮子的雌蕊；睡蓮則無蓮蓬構造(圖3、4、5)，其花朵中心為被雄蕊及附屬物環繞成圈的柱頭，第一天花朵開放時，雄蕊呈直立狀，中央柱頭分泌許多柱頭液，像極一個圍有柵欄的小水池，吸引授粉昆蟲前來，第二、三天雄蕊開裂、釋出花粉，雄蕊上端相碰、包住柱頭(圖6、7)，因柱頭液有介面活性劑功能，昆蟲帶著花粉失足落入柱頭池，將難以爬出而溺死其中，因而完成授粉。
荷花花瓣為橢圓形至長橢圓形，每個花瓣不定程度地內凹，形狀如船，而睡蓮花瓣較為尖窄，長橢圓、披針呈倒卵形。此外，花朵色彩亦有區分，睡蓮花色鮮豔繁多，舉凡紅、橙、黃、綠、藍、靛、紫等，都可以找到；荷花目前只有白、紅、黃(黃綠)或其中間色、漸層色，並無藍紫色系。
►小知識：
蓮的同一朵花中，柱頭通常先進入適合受粉的階段，之後雄蕊才大量散出花粉，這種現象在植物學上稱為「雌蕊先熟」（Protogyny），是蓮花（Nelumbo nucifera）避免自花授粉、促進異花雜交演化出的一種精巧機制。蓮花單朵花的開放期約為 3 到 4 天，其雌、雄蕊的成熟時序具備明顯的先後階段：第一天（雌性期）清晨花朵初開（通常僅微開一小孔或半開），此時柱頭已經發育成熟並分泌黏液（柱頭液），具備極佳的受粉能力；但此時周圍的雄蕊花藥尚未開裂，完全不釋放花粉。昆蟲攜帶其他植株的花粉進入時，能完成異花授粉。到了傍晚，花瓣會重新閉合。第二天（雄性期 / 散粉期）：清晨花朵完全盛開，此時雄蕊的花藥開裂並大量釋放花粉。雖然部分柱頭仍有微弱受粉能力，但主要功能已轉為讓訪花昆蟲沾滿自身花粉，帶往下一朵剛開第一天的新花。第三至四天（凋謝期）： 柱頭乾枯變黑，失去受粉活性；雄蕊逐漸枯萎掉落，花瓣陸續脫落，中央的花托（蓮蓬）開始發育種子。
睡蓮（Nymphaea）同樣具有非常典型的「雌蕊先熟」機制，而且多數品種在防止自花授粉與誘捕昆蟲的手段上，比蓮花更加極端與精巧。 睡蓮一朵花的壽命通常也是 3 到 4 天，其成熟順序與授粉策略分工明確： 第一天（雌性期／水盆陷阱）：清晨初次開花時，中央的雌蕊柱頭盤完全露出，並分泌出大量透明清澈的柱頭液（形成一個微型液體小池）。此時四周的雄蕊全部向外緊貼花瓣，花藥緊閉、完全不散粉。前來訪花或鑽入避夜的昆蟲（如小型甲蟲、蜜蜂、食蚜蠅）若身上帶有其他花朵的花粉，掉入或踩入中央的柱頭液池時，花粉被洗落溶解於黏液中，精準完成授粉。部分熱帶睡蓮傍晚甚至會閉合花瓣將昆蟲「軟禁」一整夜。 第二天（雄性期／花粉爆發）：第二天清晨再次開花時，中央柱頭盤的黏液已經完全乾涸萎縮，失去受粉活性。 周圍的雄蕊開始成熟開裂，向內彎曲蓋住中央柱頭，並爆開釋放出大量乾燥金黃的花粉。 昆蟲在花心爬行或掙脫爬出時，全身會沾滿嶄新的花粉，飛往下一朵剛開第一天的雌性期睡蓮。 第三天後（凋謝期）： 花粉釋放完畢，整朵花花力耗盡，花瓣閉合並沉入水中或倒伏水面枯萎發育果實。
- 果實：
荷花之果實俗稱蓮子，老熟後果皮變成黑褐色，結構緻密、極為堅硬，只有底部有小孔，可讓蓮子進行極其微弱的呼吸作用，維持生機。1950年代，在中國大連普蘭店出土一種堅硬如石，外殼已碳化的蓮子，經測定此古蓮子年代最久達1288年，最短的也有400年歷史，後來贈予許多國家的植物園試種，竟先後發芽茁壯、開花，是當時國際植物界的一大奇聞，它也是目前為止保存最久還能夠發芽開花的植物種子，試想1200年前，正值唐、宋時期，普蘭店市蓮花滿開的模樣，有如江南風韻令人神往，同時也令人讚嘆植物的奧妙！
睡蓮之果莢及種子(圖8、9、10)與荷花大相逕庭，許多人甚至沒印象見過睡蓮種子，因其種子細小，果莢成熟在水中開裂後，一顆顆有如芝麻般的種子，藉著假種皮的浮力漂散而開，也就很難讓人注意到了。
- 地下莖：
荷花及睡蓮均為多年生具地下儲存器官之植物，荷花之地下莖(rhizome)即為蓮藕，橫生於土中，藕條藕節上具側芽，可抽出並生的葉及花，挺水而出。每年約7月~10月為臺灣南部荷花主要結藕期，藕條在地下膨大成主藕，亦可側生出子藕及孫藕，可作為來年種苗之用。
睡蓮則因生長氣候不同，地下莖分化亦不同──一般生長熱帶睡蓮之地下儲藏器官可分為塊莖(tuber)、直立型根莖(erect rhizome)、走莖(stolon)；耐寒性睡蓮則為水平型根莖(horizontal rhizome)或短的直立型根莖。睡蓮之塊莖根莖目前無食用之用途，其主要為植物儲藏功能，度過不良環境，其上亦會增生小苗，可作為來年種苗之用。
圖3、4、5. 乾燥之蓮蓬及帶有果皮之成熟蓮子(左)，荷花花朵(中)中央具蓮蓬，睡蓮中央無蓮蓬。
圖6、7. 睡蓮第一天開放的花(左)，可見中央柱頭池；第二天的花(右)，可見雄蕊將柱頭包覆遮住。
圖8、9、10. 睡蓮已授粉之花朵外觀(左)，花瓣及雄蕊去除後為主要果莢所在(中)，剝開後內含種子細如芝麻(右)，可知其與荷花所產生的種子(蓮子)有極大差異。
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