以雙限制酶切位點標定法開發甘藍品種鑑別SNP套件 - 農業知識入口網

摘 要

　　本研究以甘藍為對象，運用次世代定序技術中的 ddRADseq 進行基因體分析。通過 對 112 個育種材料的定序與分析，成功識別 745,196 個變異位點，其中包括 648,810 個 SNP 位點。經嚴格的條件篩選，保留 3,565 個高品質 SNP 位點，並藉由這些 SNP 之基因 型值，建構甘藍育種材料遺傳異質性及遺傳歧異性資料，為材料管理與育種提供豐富之 參考訊息。由其中挑選 8 組可區分 109 個品系之 SNP 合成分析套組，於 24 個驗證材料 中之可用性試驗結果顯示，本分析套組具高度的穩定性及可靠性。本研究不僅開發輔助 甘藍育種之分子標誌套組，建立之甘藍 ddRADseq 試驗與分析流程可經濟且快速的獲得 大量樣品的基因型值，可作為甘藍分子輔助育種及基因定位有利工具。

關鍵字：甘藍、單一核苷酸多型性、雙限制酶切位點標定法

臺中區農業改良場研究彙報第165期