臺南區農業改良場研究彙報第84號-芒果種源親緣關係分析 - 農業知識入口網

為了解本場蒐集之育種材料及後代品系間之親緣關係，本試驗利用 two-enzyme genotyping by sequencing 方法探勘芒果全基因體之單一核苷酸多型性 (single-nucleotide polymorphism, SNP)，共計探勘了 142,882 個 SNP 變異位點，經由篩選和刪節後保留 6,375 個 SNP 進行族群分群及建立親緣樹。當族群分群為兩群時 (k = 2)，美國品種與其後代及臺 灣自行選育品種多在同一族群，東南亞品種及其他國家蒐集品種多在另一個族群。透過親緣 樹上相對位置可了解品種間之遺傳歧異度，過去因植株及果實特徵相似，被懷疑是否為同一 品種 ( 系 ) 之材料亦可藉由親緣樹位置遠近幫助釐清「同物異名」之可能性，種原親緣關係 分析有助於未來育種工作進行與應用。