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選育與黑葉不同產期、豐產及產量穩定、品質與風味具有特色之優良品種，為荔枝育種之目標，育種目標的選定：

一、適應性廣，果實能行銷於全國及至全世界。
　　理想型（Idea Type）選種。
　　選拔強度強，淘汰率高，品系種比較試驗及區域試驗工作量少。

二、具有特色，以品種多樣化為解決產業問題的方法。
　　選拔強度較弱，淘汰率較不高，品系比較試驗及區域試驗工作量大。

　　經過多年的努力，農業試驗所已選出極早熟品種「台農2號旺荔」與極晚熟品種「台農3號玫瑰紅」，兩者品質均較現同期商業品種優良，另產期與「玉荷包」相近之新品種「台農1號翠玉」質優、豐產且產量穩定栽培容易，可提供農友另一個選擇。

目前所缺乏者有下列二種，

(一)產期約在5月下旬，即產期介於「三月紅」及「玉荷包」之間的品種。

(二)產期在6月下旬，即產期約與糯米糍相近的品種。糯米糍品質甚佳但產量低，使其推廣不易，未來應有豐產、質優之品種與其搭配，以提供農友另一個選擇。農業試驗所目前已有些品系具有上述的特性，正在持續試驗觀察中，若一切順利應可在2~3年後取得品種權，有助於解決目前主要栽培品種單一的問題，屆時台灣荔枝產業將會有一番新的局面。