臺灣有機認證 - 農業知識入口網

國際有機農業比臺灣要求更嚴格，如以下幾項重要的標準，臺灣是大部份沒有要求的；
１．禁止使用基因或化學資材及藥劑；（有機基本標準）
２．農場建設必需以生態工法為主； （新建設部份）
３．農地需保留５％以上的生態棲息地；（含濕地面積）
４．耕作地每年應有２５％休耕植綠肥；（豆科作物）
５．耕作地四期中需三科以上作物輪作；（含豆科一種）
６．長期作物必需以草生或間套作綠肥；（豆科作物）
７．動物飼料５０％以上應是本場所生產。 （CB認可的）
當然不只是這些規範而已，但以上這些重要規範在臺灣只是少部份被要求，所以臺灣的有機農業目前是無法與國際比較。

有機認證機制在台灣，除了有費用高昂，不利有機小農生存的弊病之外；有專家指出，台灣認證機制太過僵化，未能因地制宜，反而會扼殺作物的生機，造成作物殘留過量硝酸鹽，讓吃的人受害。
有機認證的任務應該是：讓生產者能安心生產且有合理收益，並使消費者能吃得起且真能獲得健康。

台灣大約在1997年起陸續有不同團體發起認證制度和標章，目前以國際美育自然生態基金會(MOA)、慈心有機農業發展基金會(TOAF)、臺灣省有機農業生產協會(TOPA等三個非營利團體經過政府授權可擔任驗證工作。