如何分辦細菌 真菌 - 農業知識入口網

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細菌與真菌的差異性頗大，細菌沒有細胞核和胞器，例如我們熟知的大腸桿菌與乳酸菌等。真菌是真核生物有細胞核，例如：橘子表皮的青黴菌。
在感染植物的微生物中，真菌與細菌的病徵並無法絕對區分，大致而言：
1.細菌常造成葉片黃暈、水浸狀或組織潰爛。2.真菌造成葉片或植株枯萎，壞疽等外部型態。但這樣的敘述是不足的，許多真菌與細菌所造成的病徵相當類似，須要植物醫生（植物保護）人員仔細分離鑑定之後才能確定。因此對於個別作物的受害病徵，除非是相當典型的病徵否則仍建議送至農委會所屬各個改良場所給專業人員鑑定，比較不容易出錯。
另外，日常發酵通常是酵母菌的作用--真菌。黑殭菌是一種能使昆蟲致病的真菌，黑殭菌由害蟲皮膚感染，使分生孢子萌發，感染昆蟲，是一種安全的害蟲防治。菌根菌可以幫助植物根部吸收養分，特別是磷肥的吸收---真菌。溶磷菌是多種菌的混合稱呼，可以幫助土壤肥料釋放，使植物得以吸收統讓中被固定的肥份--包含細菌與真菌。