2012年有機農業研究團隊研發成果研討會--國際有機種子產業和短期葉菜有機採種試驗-有機種子採種和育種 - 農業知識入口網

傳統種子和有機種子的採種技術兩者相似，唯一區別是有機種子採種田須採用有機農法並取得認證，由於有機農法禁用化學肥料和農藥，因此有機採種田控制病蟲害較困難，以致有機種子感病的風險增加，但歐盟的STOVE(Seed Treatment for Organic Vegetable production)又更改規定，要求有機種子感病率須低於0.01%，所以有機採種的田間衛生(sanitation)和控制種傳病害就變成很重要(Gail, 2005)。由於禁用農藥所以露地採種的有機種子感病的風險增加，尤其二年作物生長期更易感病，已有許多的地區採用溫室採種，因為可以控制環境和避免污染，避免種子受到病害感染，紐西蘭已用保護栽培在有機種子採種(Walker, 2003)。
使用有機種子有三個理由：(1)有機農業法有規定，所以驗證機構要求有機栽培用須要有機種子，(2)減少上游傳統生產帶來的污染，(3)發展有機農法栽培品種。這三個理由對發展有機種子都很重要，其中第三點發展有機農法栽培品種更是有機農業的基礎，因為適當有機栽培的品種，可以補有機農法的不足。因為有機農法內函不是只有不能使用禁用資材清單，而是有機農業系統不同於傳統農業，有機栽培的品種須具抗/耐病蟲害，要能與雜草競爭，能在土壤和環境氣候逆境下生長，因此適合有機栽培的品種特性會不同於傳統品種。針對上述品種特性之需求，已有種子公司和育種家在發展適合有機栽培的品種(Colley, 2011)，這些品種具生長勢強，地上部形成遮蔽效果早以抑制雜草生長，耐低溫等氣候逆境，植株根系生長快生長勢強而且分佈密，所以吸肥力強，尤其有機栽培禁用農藥更須要能抗病蟲害品種。Grube (2007)報告有機蔬菜生產規模比傳統蔬菜小，而且操作也多樣化，尤其栽培環境、土壤和灌溉也多變，所以有機品種育種須要遺傳多樣化以配合多樣化的栽培環境和操作(Ceccarelli and Grando 2007；Dawson et al., 2008)。